护航舰作为舰队中承担防御与战术支援的核心单位，其编组优化直接影响战场生存效率与战术执行力。合理的前中后排站位分配是基础，前排应配置高护甲与血量的舰船，例如奇美拉级或ST59，用于吸收敌方火力；中排需兼顾攻防平衡，可选择能量输出型或综合型舰船；后排则集中高伤害鱼雷艇或导弹舰，如卡利斯托级或蜂巢守卫者，确保对敌舰的压制力。舰船移动速度的同步性也需重点考虑，避免因低速单位拖累整体机动性。
武器攻击序列的针对性调整能显著提升输出效率。护航舰的主武器应优先锁定敌方护卫舰或驱逐舰等小型目标，而防空模块需专注拦截战机和护航艇。部分鱼雷艇的武器序列可通过技术值强化调整为优先攻击巡洋舰或战列舰，以应对不同规模的敌方编队。舰载机的搭载策略需与护航舰互补，例如配备RB7-13型导弹艇或林鸮战机增强对空火力，但需注意护航艇容量与战机数量的平衡，避免过度占用指挥值。
战术功能的差异化编组是高阶优化的关键。拆分组队时，可单独组建高速侦查队（如FG300侦察型）负责曲率跳跃和战场视野控制，而主力接战队则保留至少6艘以上前排舰船形成互相掩护的阵型。特殊场景下可配置纯攻城舰队（如诺玛M470搭配云海级），利用高移速执行后方破坏任务。维修舰船在中后期实战中效果有限，通常建议替换为输出单位，仅在与NPC作战时临时编入。
支援系统的协同能进一步强化持续作战能力。支援舰与分舰队建筑的对接可大幅提升自动维修速度，并通过生产线快速补充舰载机或护航艇。这一机制尤其适合长期远离基地的远征作战，但需提前规划对接点的资源消耗与生产队列优先级。部分护航舰的旗舰技能（如游击切入作战）可针对性强化侧翼突袭效果，需结合舰队整体战术选择触发时机。
动态调整是应对复杂战局的核心原则。敌方若以舰载机为主力，需增加光锥级防空舰的比例；若以战列舰为核心，则需提升鱼雷艇与高穿甲火力的占比。编组完成后，应通过模拟战斗或小规模遭遇战验证实际效果，并根据战报数据微调舰船技术值分配与武器序列。最终优化的目标是在火力、生存与机动性之间找到最佳平衡点，而非追求单一属性的极致化。
